Depuis 2008, Alter'Incub bénéficie du soutien de l'Europe (Fonds Européen de Développement Régional) et de la Région Occitanie Occitanie Pyrénées-Méditerranée (anciennement Région Languedoc-Roussillon).
Il a été le premier dispositif national d’innovation non technologique à émarger sur des fonds FEDER.
Ce financement permet de proposer un accompagnement de qualité, gratuit pour les porteurs de projets incubés qui sont issus des départements de l'Aude (11), du Gard (30), de l'Hérault (34), de la Lozère (48) et des Pyrénées-Orientales (66).